使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用
Using quantitative molecular surface analysis function of Multiwfn to predict reactive site and analyze intermolecular interaction
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-Aug-6 Last Update:...
AM4动漫同人歌曲演唱会杂谈、照片和演出录像
文/Sobereva(3) 2012-Jul-25
AM4动漫同人歌曲演唱会于2012年7月22日,在北京和上海两地的MAO LIVE HOUSE同步举行。这一天正好是在国家会议中心的Fate only同人展,很想去,但是和AM4冲突了。对我来说,显然还是AM4更重要。
帝都的MAO LIVE HOUSE是在鼓楼附近,以前没怎么去过,走到那里,感觉到浓郁的文化氛围,街边都是小平房,...
伪全息影像显示蛋白质动力学轨迹
Pseudo-holographic movie revealing protein dynamics trajectories
文/Sobereva@北京科音 2012-Jul-18
现在廉价的伪全息影像实现方法已经在网上盛传,寡人也做了一个,虽然原理十分简单,但实际看上去比想象得更有趣。大家基本都是用这技术来显示Miku等角色的舞蹈,寡人靠VMD做了个蛋白质伪全息视频,效果不错,如下图所示...
在赝势下做波函数分析的一些说明
Some instructions on wavefunction analysis under pseudopotential
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-Jul-17 Last update: 2019-Jun-3
经常有人问在赝势下能不能做AIM分析、Multiwfn (//www.umsyar.com/mult...
注:北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)里面专门有一节“金属的模拟”非常全面详细讲使用GROMACS计算金属体系的方方面面,给了大量例子,内容远比此文深入详细全面得多,欢迎需要相关知识者参加。
在Gromacs中模拟金纳米线拉伸过程
Simulating stretching process of gold nanowire in Gromacs
...
使用Multiwfn绘制原子轨道图形、研究原子壳层结构及相对论效应的影响
Using Multiwfn to draw atomic orbitals, study atomic shell structures and the influence of relativistic effects
文/Sobereva @北京科音 2012-Jul-9
1 前言
这个帖子主要介绍怎么用Multiwfn程序(http:/...
能绘制原子球上带十字形线的分子结构图的几种软件和用法
Several software that can draw molecular structure maps with cross-shaped lines on atomic spheres
文/Sobereva@北京科音 2012-Jul-7
1 关于椭球图和十字形线
经常看到有人问用什么可视化软件可以让显示的分子结构图上每个原子上有个十字形线...
CFOUR程序的编译和使用方法简介
An introduction to compiling and using the CFOUR program
文/Sobereva @北京科音 2012-Jul-5
1 前言
CFOUR程序的全称是Coupled-Cluster techniques for Computational Chemistry。它是由ACESII-MAB程序改名而来,而ACESII-MAB程序...
注:后来发布了AICD 2.0,安装和使用比此文介绍的老版本方便得多,因此一定要看此文:《使用AICD 2.0绘制磁感应电流图》(//www.umsyar.com/294)
使用AICD程序研究电子离域性和磁感应电流密度
Study of electron delocalization and magnetically induced current density using AICD program
文/Sobereva ...