在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法 Easily drawing a cube file as an excellent isosurface map in VMD 文/Sobereva@北京科音 2019-May-21 1 前言 Multiwfn（//www.umsyar.com/multiwfn）是产生 研究和波函数分析中用到的各种格点数据特别方便、强大的工具，可以在自带的...
Simulating UV-Vis and ECD spectra using ORCA and Multiwfn
Simulating UV-Vis and ECD spectra using ORCA and Multiwfn Written by Tian Lu (sobereva@sina.com), 2019-May-20 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences (http://www.keinsci.com) 1 Introduction In ...
使用Multiwfn绘制态密度(DOS)图考察电子结构
使用Multiwfn绘制态密度(DOS)图考察电子结构 Plotting density-of-states maps by Multiwfn to study electronic structure 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-May-14 Last update: 2024-Jul-31 0 前言 基于主流 程序产生的波函数信息，使用Multi...
巨大体系的范德华表面静电势图的快速绘制方法
重要提示：下文是很早以前写的，如今已经没意义了！如今使用Multiwfn官网上的最新版本，结合下文提到的xtb产生的molden文件作为输入文件，直接用《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》（//www.umsyar.com/443）介绍的ESPiso脚本绘制才是最好的做法。因为后来得益于《Multiwfn使用的高效的静电势算法的介绍文章已于PCCP期刊发表！》（//www.umsyar.com/614）中介绍的Multi...
2019年4月完结动画简评
2019年4月完结动画简评 文/Sobereva 2019-May-2 本文是笔者完整观看过的2019年4月完结的24部全长TV版动画和6部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份，怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话（扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/forum-68-1.html里的相应帖子里写了），没追的要么是笔者对其题材有抗拒（比如恐怖或者胡搞类），要么就是由...
使用Multiwfn一键批量产生各类光谱图（含演示视频）
本文配有操作演示视频，强烈建议一看：https://www.bilibili.com/video/av50818216 使用Multiwfn一键批量产生各类光谱图 Using Multiwfn to batch generate various spectra with one click 文/Sobereva@北京科音 2019-Apr-29 0 前言 如果读者还没看过《使用Multiw...
使用Multiwfn绘制光电子谱
使用Multiwfn绘制光电子谱 Using Multiwfn to plot photoelectron spectrum 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Apr-27 Last update: 2020-Sep-28 1 前言 波函数分析程序Multiwfn（//www.umsyar.com/multiwfn）具有很方便、灵活、强大的态密度(DOS)绘...
谈谈记录化学体系结构的xyz文件
谈谈记录化学体系结构的xyz文件 Introduction to the xyz file recording chemical structures 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Apr-26 Last update: 2023-Jun-14 xyz是一种非常常用的记录化学体系结构的文件格式，定义极其简单。笔者开发的好多程序，以及其它计算化学程序经常涉及这个格式，网上...
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果）
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果） A super lazy script to calculate RESP atomic charges (one line of command calculates the result) 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Apr-17 Last update: 2022-Aug-6 RESP电荷主要优点是特别适合对柔性分子做分...
亲历触手猴在帝都的钢琴演出有感
亲历触手猴在帝都的钢琴演出有感 文/Sobereva 2019-Mar-27 昨日晚上7:30参加了触手猴的在北京的中山公园里面的中山音乐堂的演出。真没想到我十年多前看到的那个在视频里弹奏touhou曲子的人物，居然会来北京。 其实我之前对触手猴也没有太多了解，但是在B站上偶然发现他会来北京巡演，感觉实属难得，就买了280的票去了。其实期待度不算特别高，刚到场时候感觉观众也有点稀稀拉拉，有不少空位，也因此二楼都没有开放。但看完...
详谈使用Gaussian做势能面扫描
详谈使用Gaussian做势能面扫描 Detailed introduction to using Gaussian to perform potential energy surface scanning 文/Sobereva@北京科音 2019-Apr-1 目录 1 基本知识 2 用Gaussian做刚性扫描的方法和实例 2.1 基础知识 ...
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用 Use of Packmol to construct initial structure of molecular dynamics 文/Sobereva@北京科音 2019-Mar-23 由于经常有人问Packmol怎么安装、怎么用，这里就写一篇文章，做一个完整的介绍，初学者应该都能读懂，之前用过的人看了可能还能了解一些之前没注意到的细节和技巧。笔者在北京科音的分子动力学与G...
将多帧xyz文件转化成 输入文件的工具：xyz2QC
将多帧xyz文件转化成 输入文件的工具：xyz2QC xyz2QC: A tool to convert multi-frame xyz files to input files of quantum chemistry program 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Mar-17 Last update: 2021-Aug-26 1 前言 笔者开发的免费的...
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
PS：本文可能经常更新，内容始终是对于Multiwfn官网上最新版本而言的，不要用老版本程序、看老版本手册！ Multiwfn支持的分析化学键的方法一览 An overview of chemical bond analysis methods supported by Multiwfn 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Mar-19 Last update: 20...
2018年度完结动画总评
2018年度完结动画总评 文/Sobereva 2019-Mar-7 此文对笔者完整看过的2018年度完结的97部全长版TV动画和19部泡面番进行总评。剧场版、OVA之类的都没有纳入其中。此文只有“2019年1月完结”部分是新写的，4月、7月、10月完结的动画的评论在作品刚完结之时就已经写好并发在了blog上，在此文只是汇总而已（所以有些文字现在看起来已经out了），不过很多作品的总评分为了保持评价的一致性，在此文又做了微调。前几年的总评...