使用Multiwfn展现过剩电子(excess electron)并计算它的回转半径 Using Multiwfn to exhibit excess electrons and calculate their radius of gyration 文/Sobereva@北京科音 2023-Jan-30 1 过剩电子的展现 化学领域里的过剩电子(excess electron)通常是指定有电子比较集中地...
sobeig:计算矩阵本征值和本征矢的便捷小程序 sobeig: a convenient utility for calculating matrix eigenvalues and eigenvector 文/Sobereva@北京科音 2023-Jan-28 自己写程序求解矩阵的本征值和本征矢极其简单。但有时候需要对给定的矩阵随手求一下本征值和本征矢,一般的计算器程序又没有这个功能,往往又懒得写或来不及现写个...
使CP2K计算的振动模式可以被GaussView观看的程序:MfakeG MfakeG: A tool that enables vibration modes calculated by CP2K to be viewed with GaussView 文/Sobereva@北京科音 2023-Jan-22 GaussView在观看振动模式方面非常好用,可以方便地显示振动矢量,播放和保存振动动画,还可以沿特定的...
谈谈记录化学体系结构的mol2文件 Introduction to the mol2 format for recording chemical structures 文/Sobereva@北京科音 2022-Dec-31 1 mol2文件简介 mol2文件是计算化学领域非常常用的记录分子结构的格式,被很多程序所支持和利用。例如VMD、GaussView、Chem3D、OpenBabel、AmberTools里的...
在VMD中使用GaussView的元素着色的方法 Using GaussView element coloring scheme in VMD 文/Sobereva@北京科音 2022-Sep-16 GaussView的元素配色总体上来说不错,而且对所有元素都定义了唯一的颜色,在File - Preference - Colors - Element Colors中可以看到所有元素的颜色,如下所示 ...
详谈使用CP2K产生给Multiwfn用的molden格式的波函数文件 On the using CP2K to generate wavefunction files in molden format for Multiwfn 文/Sobereva@北京科音 First release: 2022-Aug-31 Last update: 2024-Jun-4 0 前言 强大的波函数分析程序Mult...
使用Multiwfn计算特定方向的UV-Vis吸收光谱 Simulating UV-Vis absorption spectrum in specific directions using Multiwfn 文/Sobereva@北京科音 First release: 2022-Jul-8 Last update: 2024-May-14 0 前言 通过 或第一性原理计算,得到理论...
使用Multiwfn对静电势和范德华势做拓扑分析精确得到极小点位置和数值 Using Multiwfn to perform topology analysis for electrostatic potential and van der Waals to exactly obtain positions and values of their minima 文/Sobereva@北京科音 2022-Jul-4 ...
使用Multiwfn计算分子和晶体中孔洞的直径 Using Multiwfn to calculate cavity in molecule and crystal 文/Sobereva@北京科音 2022-Jun-30 0 前言 化学研究中经常涉及到孔洞尺寸的问题,这和分子吸附、化学物质分离、分子识别等很多问题有关。Multiwfn有展现化学体系孔洞并计算其体积的功能,见《使用Multiwfn图形化展...